A l’avènement de Mehmed III, fils des Mourad III, la guerre contre l’Allemagne continuait depuis 1592, mais on n’obtenait plus de résultats rapides et décisifs comme auparavant. Le Sultan partit en campagne à l’exemple de son aïeul, Soliman II, le Magnifique. Le 12 octobre 1596, il enlevait le fort d’Eger, en Hongrie, aux Allemands dont la puissante armée fut écrasée le 26 octobre à la bataille de Haçova.

En 1601, l’Archiduc Ferdinand, le futur empereur, attaqua la place turque de Kanije, mais fut repoussé et défait par Tiryâki Hasan Pacha.

Le 28 novembre, Mehmed III mourut à 37 ans. Son fils de 14 ans, Ahmed, lui succéda.